Bahse konu olan ihbarların ardından İmamoğlu’nun diplomada sahtecilik yaptığına dair Yüksek Öğrenim Kurulu (YÖK) tarafından hazırlanan rapor, soruşturmaya zemin hazırlamıştı. İmamoğlu, resmi belgede sahtecilik suçlamasıyla şüpheli olarak ifade vermiş ve İstanbul Üniversitesi Rektörlüğü’ne de iki kez yazı gönderilmesiyle birlikte, İmamoğlu’nun da bulunduğu 28 kişinin diplomasının iptal edildiği açıklanmıştı.
Raporda, 1990 yılında gerçekleştirilen yatay geçişlerle ilgili olarak 55 öğrenci için karar alındığı ve toplamda 60 kişilik kontenjanın bulunduğu ifade edilirken, bu kontenjanın arttırılma sürecinin hangi makam tarafından yapıldığına dair bilgiye ulaşılamadığı vurgulandı. Yönetim kurulu kararıyla bu sayının 80’e çıkartıldığına dikkat çekilirken, yatay geçişlere dair bazı işlemlerin şüpheli olduğu kaydedildi.
İlgili raporda, İmamoğlu’nun da aralarında yer aldığı bazı öğrencilerin yatay geçiş işlemlerinin kaydı yapılırken yanlış bir şekilde Doğu Akdeniz Üniversitesi öğrencisi olarak geçirildiği belirtildi. Bazı öğrencilerin transkriptlerinde başarısız ders notları olmasına rağmen kayıtlarının yapıldığı da yapılan tespitler arasında yer aldı. Ayrıca, YÖK’ün belirttiği Doğu Akdeniz Üniversitesi dışında diğer tüm kurumların yatay geçiş taleplerinin değerlendirildiği ifade edildi.
Raporda, 10 kişilik kontenjan için yalnızca 3 kişilik kontenjanın yurt dışından yapılacak başvurulara ayrılması gerektiği, bunun dışında kalan taleplerin mevzuata aykırı olarak kabul edildiği tespit edildi. 1990 yılında yapılan başvurularda, bazı öğrencilerin gerekli şartları taşımadığı halde kabul edildiği ve benzer şekilde, önceki yıllarda da yatay geçişlerin kabul süreçlerinin gözden geçirilmesi gerektiği dile getirildi.